Avec l'extérieur de la mosquée, l'architecte Sedefkâr Mehmet Ağa (élève et assistant principal du célèbre architecte Mimar Sinan) a réussi à orchestrer un effet visuel similaire à celui de l'intérieur de Sainte-Sophie. Ses courbes sont voluptueuses; il a six minarets (plus que n'importe quelle autre mosquée au moment où il a été construit); et sa cour est la plus grande de toutes les mosquées ottomanes. L'intérieur a aussi une grande échelle: les carreaux d'Iznik se comptent par dizaines de milliers; il y a 260 fenêtres; et l'espace de prière central est énorme.

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Après la paix de Zsitvatorok signée par Ahmet Ier avec l'archiduc Matthias d'Autriche, qui mettait fin à la guerre avec la Hongrie sans victoire ottomane décisive (1606) et le résultat défavorable des guerres avec la Perse, le sultan Ahmed I a décidé de construire une grande mosquée à Istanbul. Ce serait la première grande mosquée impériale à être construite en plus de quarante ans. Ses prédécesseurs avaient payé leurs mosquées avec leur butin de guerre, Sultan Ahmed I a dû retirer les fonds du trésor provoquant la colère des oulémas, parce qu'il n'avait pas gagné de victoires notables pendant son règne.

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La mosquée a construit sur le site du palais des empereurs byzantins, face à la mosquée Sainte-Sophie et l'hippodrome, un site de grande signification symbolique. Le côté sud de la mosquée repose sur les fondations et les voûtes du Grand Palais. Plusieurs palais y ont déjà été construits, notamment le palais de Sokollu Mehmet Pacha, donc ceux-ci ont dû être achetés à un coût considérable et démolis. De grandes parties de la Sphendone (tribune courbe avec structure en U de l'hippodrome) ont également été enlevées pour faire place à la nouvelle mosquée. La construction de la mosquée a commencé en août 1609.